在建工程余额指的是企业在建的未完工程项目的成本与收入之间的差额，即在建工程成本减去已确认收入的金额。

这个余额通常表示企业在建项目的净额，也就是企业还能够从该项目中获得的净利润。在建工程余额是一个重要的财务指标，可以反映企业当前在建项目的盈利能力和财务风险。

同时，这个指标也是企业在进行投资决策和风险评估时的重要参考依据之一。