转运蛋白分为两类，一类是载体蛋白（carrier protein)，它的一侧与溶质结合，经过载体构象的变化，把溶质转运到膜的另一侧。利用这种方式转运的溶质，既可以是小的有机分子，也可以是无机离子。

另一类是通道蛋白（channel protein)，与载体蛋白不同，它在膜上形成极小的亲水孔，溶质能扩散通过该孔。